医疗净化工程最先用于在医院的手术室，也就是医院当中使用的手术室净化工程。最开始它只是广泛(extensive)的应用在矫形手术中,因为矫形手术时间较长,易于引起感染。现如今医疗洁净室获得空气净化工程应用的其它领域有分娩(delivery)室、保育室、烧伤室、心脏病人护理单元等。最新进展之一是牙外科手术洁净室的应用,它降低（reduce)了在长期手术过程中医务人员被感染的危险。
洁净室作为医院重要的功能分区之一，其工程质量直接影响到医院的使用和对患者的治疗。要提高手术室净化的工程质量，必须从设计、施工和维护三方面同时重视。
医院应用洁净环境最广泛(extensive)的手术室净化，是用空气洁净技术取代传统的紫外线（Ultraviolet rays)等手段对全过程实行污染控制（control)的现代手术室。无菌手术室装修采用空气洁净技术对微生物污染采取程度不同的控制，达到控制空间环境中空气洁净度适于各类手术之要求；并提供适宜的温、湿度，创造一个洁净舒适的手术空间环境。由于手术室要严格控制低细菌数及低麻醉气体浓度，所以层流超净装置的稳定性是层流净化手术室的重要验收指标。在手术室净化内，患者感染率可降低（reduce) 10 倍以上，从而可以少用或不用会伤害患者免疫系统的抗生素。既要无尘又要无菌（fungus)(意思:没有活菌)是手术室净化的特点。
医院洁净室包括手术室、产科、婴幼儿病房(NICU)、ICU(重症监护室)、烧伤病房及解剖室、净化实验（experiment)室、人工透析室、标本室等，其工程质量与医疗质量有着直接而重要的关系。
医院手术室净化设计
我国《洁净室施工及验收标准》(以下简称“标准”)强调，新风必须遵循三级过滤的原则。无菌手术室净化同级别的层流手术室其空气洁净度标准不同，例如国内标准I级层流手术室的标准为洁净度5级，每立方尺空气中≥0.5μm的尘粒数，≤100颗或每升空气中≤3.5 颗。II级层流手术室的标准为洁净度6级，每立方尺空气中≥0.5μm的尘粒数，≤1000颗或每升空气中≤35颗。成都手术室装修公司使用层流手术室，强化无菌观念和正规化管理仍然是医疗程安全的根本保证与要求，仍然是手术室工作之根本、之重点，只有当两者紧密结合起来才是趋于完美的。这是因为和空调系统相比，净化系统新风的尘浓负荷比高达 90% 以上，因此，为了运行质量必须强调新风三级过滤。现在医院洁净手术部的标准和标准中都已将此作为规定。另外，回风必须有过滤器(作用:过滤杂质等)，能放中效最好。设计人员只有准确理解了“标准”的要求，才能使洁净室最大程度地满足医院的功能要求。
设计人员要确保手术室净化质量，还必须对医院洁净室施工现场做认真地调研、考察，否则，设计出来的工程质量就会大打折扣。如在对洁净室做含尘浓度检测时，突然发现尘浓普遍急剧上升，超标严重。手术室净化工程人员首先想到的是过滤器(作用:过滤杂质等)风口漏，经巡查，虽然发现确实有漏，但和检测出的尘浓数量不相当。根据经验（experience)判断，这是新风口设计不当。